En medio de la compulsa de copias que hizo la Fiscalía General de la Nación a la comisión de acusaciones y la sala penal de la Corte Suprema de Justicia para que se investigue al ex presidente Álvaro Uribe Vélez por la masacre del Aro, el ente acusador pidió que se indague a fondo sobre  la muerte de Pedro Juan Moreno, quien fue secretario de Uribe cuando este era gobernador.

Moreno se enteró por boca del ex jefe paramilitar Carlos Castaño de la masacre y según varias investigaciones se habría intentado silenciarlo.

Cabe recordar que Moreno además habría estado implicado en la muerte de Jesús María Valle, el defensor de derechos humanos que denunció las irregularidades que hubo detrás de la masacre ante las autoridades pertinentes.

Por estos hechos la Fiscalía creó una comisión especial para que se investiguen ambas muertes dentro de la compulsa de copias.